据集装箱分公司2016年半年报显示，公司上半年整体生产经营基本面总体平稳，实现了时间过半，任务过半。上半年完成集装箱吞吐箱量270944.25TEU，达到年度预算的50.2%；完成营运收入7600.22万元，达到年度预算的50.7%；实现净利润2247.80万元，达到年度预算进度的64.2%。

　　受国际国内经济形势影响，2016年上半年集装箱运输市场持续低迷，船公司大面积亏损，与公司有业务关系的多家内贸船公司经营困难乃至关门停业，包括南通港集装箱分公司在内的长江下游多家集装箱码头公司面临货量严重不足的境况，同质竞争异常激烈。与此同时，交通部费改办法实施后，多个服务项目按规定停收或降低费用；装卸费率也因低价竞争影响而下调，导致营收下降。

　　面对方方面面严峻形势和困难局面，集装箱分公司凝全员智慧、举全司之力，想方设法度难关，千方百计创效益。市场开发狠抓箱量项目不放松，以大宗货源稳客户拓市场，以“短平快”箱量保稳定促增长，以特种业务作补充增收入。公司总经理室多次带队走南闯北开发市场、逐家挨户走访客户。依托集团，大力推进“散改集”项目，采用专人负责、延长堆存期、换单费用优惠等措施吸引货源，成功组织了化肥、硫磺、高粱、小麦、玉米、酒糟粕等业务。上半年装拆箱3090TEU，同比增长69%，实现收入80余万元。长江中上游硫磺化肥物流链项目成果突出，上半年完成了3万吨化肥、6000吨硫磺作业；与代理联合揽货机制取得较好成效，3个月来已有5家企业改港南通；由于市场低迷，为补足箱量，加大了中转箱业务的揽货力度，上半年中转箱16423TEU,同比增长33%，同时，新增了两家中转船公司；特种作业稳中有进、稳中有为，成功组织了45000立方米模块业务，开发了特种件新客户和新货源，上半年完成特种船舶36艘次，收入470万元，同比增长53%，有效补充了集装箱主业。